民國五十九年，台南教區碧岳修院孫靜潛與周克勤神父，在主教的支持與鼓勵下，聯合台北總教區狄剛副主教與王秀谷神父，以及應邀至嘉義教區工作，同時任教於碧岳修院的李震神父，共同發起創立一學術機構，從事文化福傳事工。幾經開會商討之後，碧岳學社於民國六十年二月宣布正式成立，遴選周克勤與孫靜潛神父分任總幹事和司庫，並敦請台南教區成世光主教為學社的監護主教。

學社成立之初，暫借碧岳修院的一個房間作為辦公室，其他大小事項皆付闕如。首筆經費由監護主教捐贈，西德天主教主教團和科隆總教區相繼數度慨伸援手，學社漸具經濟基礎。民國六十六年於碧岳修院內籌建專供學社使用的新樓一座，建築費用大部分由西德主教團捐助，其餘款項由台南教區補足。

學社成立後的最初二年，可謂工作的籌劃與試行階段。民國六十二年七月正式展開工作，教父與聖師名著的譯介，大致都能按照原定計畫進行。學社叢書迄今已有十餘種譯著問世，皆係與台南教區聞道出版社合作，並以聞道出版社名義出版。

民國九十七年八月向經濟部提出申請成立公司，設址於台南市開山路一九七號。九月八日經濟部回文，核准碧岳學社文化事業公司立案成立，董事長為台南教區林吉男主教，經理人即社長為費格德神父，主管學社業務。學社的發展方向將秉持一貫的信念，並期許以更切應時宜、更普及效益的多元面貌呈現。

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